Во Македонија се евидентирани дури 24 локации кои се значајни подрачја за птици. Подрачја со особено значење се трите тектонски езера (Охридско, Преспанско и Дојранско), Демиркаписката Клисура, Тиквеш и Тиквешкото Езеро, Брегалница, Пелагонија и оризовите полиња во Кочани.
