Во Македонија може да се сретнат околу 100 ендемични растенија. Поголем дел од нив се наоѓаат токму во значајните подрачја за растенија. Едни од поважните вакви подрачја се сите четири национални парка (Маврово, Галичица, Пелистер и Шар Планина) како и заштитените предели Малешево и Осогово.